Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx1Q9WV80 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms