Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnip1Q9WUU8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms