Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf13bQ9WU72 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms