Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrkQ9R0G8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrkQ9R0G8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms