Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lamc3Q9R0B6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamc3Q9R0B6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms