Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gpc6Q9R087 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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