Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2e3Q9QXZ7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2e3Q9QXZ7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nr2e3Q9QXZ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2e3Q9QXZ7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms