Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms