Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Limd1Q9QXD8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms