Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Trim44Q9QXA7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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