Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thsd1Q9JM61 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thsd1Q9JM61 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms