Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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