Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col5a3Q9JLI2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col5a3Q9JLI2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col5a3Q9JLI2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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