Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

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Length 1,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Capn15Q9JLG8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms