Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms