Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtsmQ9JL96 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtsmQ9JL96 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms