Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmgn5Q9JL35 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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