Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tmod3Q9JHJ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tmod3Q9JHJ0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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