Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms