Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms