Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl4Q9DCU6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl4Q9DCU6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms