Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ7

Scyl3, Protein-associating with the carboxyl-terminal domain of ezrin, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scyl3Q9DBQ7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scyl3Q9DBQ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scyl3Q9DBQ7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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