Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc89Q9DA73 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms