Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Subh2bvQ9D9Z7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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