Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms