Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Alkbh4Q9D8F1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Alkbh4Q9D8F1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms