Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp5Q9D7S9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp5Q9D7S9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms