Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms