Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc94Q9D6J3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms