Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms