Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc9bQ9D6E4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms