Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sdr42e1Q9D665 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr42e1Q9D665 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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