Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms