Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms