Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc130Q9D516 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc130Q9D516 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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