Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc105Q9D4K7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms