Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Phf6Q9D4J7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Phf6Q9D4J7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms