Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms