Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rsph14Q9D3W1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms