Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Krt20Q9D312 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt20Q9D312 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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