Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms