Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ift27Q9D0P8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ift27Q9D0P8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ift27Q9D0P8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift27Q9D0P8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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