Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem88Q9D0N8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem88Q9D0N8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms