Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mms19Q9D071 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mms19Q9D071 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms