Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thumpd2Q9CZB3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms