Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snf8Q9CZ28 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snf8Q9CZ28 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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