Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc8Q9CYA6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc8Q9CYA6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms