Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo1Q9CXH7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms