Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RpainQ9CWY9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RpainQ9CWY9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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