Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6kQ9CWP4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6kQ9CWP4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms